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bcr / jak2
● bcr
位于22q11.23。编码断点簇区域蛋白,由1271个氨基酸组成,是一种gtpase激活蛋白。gtpase结构域位于c-端,结合atp的丝氨酸/苏氨酸激酶结构域位于n端,另外还包含gtp/gdp转换结构域。该蛋白参与超氧化物生成的调节等生命活动。bcr基因与慢性髓性白血病(cml)、急性淋巴细胞白血病(all)等相关。
● jak2
位于9p24.1。编码janus激酶2,由1132个氨基酸组成。jak2是一种非受体酪氨酸激酶,可以应答白细胞介素-3(il-3)、粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子(gm-csf)和促红细胞生成素(epo)等生长因子或细胞因子而活化,进而激活下游的stats,开启jak-stat信号通路,参与细胞生长、发育、分化及组蛋白修饰等多种生命活动。jak2基因与骨髓增生性疾病(mpd)、急性淋巴细胞白血病(all)及慢性髓性白血病(cml)等相关。
临床解读
● bcr/jak2 对应核型常为:t(9;22)(p24;q11)
● 该融合常见于急性淋巴细胞白血病(all)、慢性髓性白血病(cml)中。截至目前至少有7例报道,其中all 4例、cml 3例。
● 患者经过jak1/2抑制剂治疗后,可缓解数月到数年不等,但后期仍会复发或出现进展,预后均较差,后期需要进行干细胞移植。
参考文献:
[1] xu y, yin j, pan j, et al. a bcr-jak2 fusion gene from ins(22;9)(q11;p13p24) in a patient with atypical chronic myeloid leukemia.[j]. leukemia & lymphoma, 2013, 54(10):2322-4.
[2] schwaab j, knut m, haferlach c, et al. limited duration of complete remission on ruxolitinib in myeloid neoplasms with pcm1-jak2, and bcr-jak2, fusion genes[j]. annals of hematology, 2015, 94(2):233-238.
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[5] álvaro cuesta-domínguez, ortega m, ormazábal c, et al. transforming and tumorigenic activity of jak2 by fusion to bcr: molecular mechanisms of action of a novel bcr-jak2 tyrosine-kinase[j]. plos one, 2012, 7(2):e32451.
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cbfa2t3 / glis2
● cbfa2t3
位于16q24.3。是一种转录抑制因子,由653个氨基酸组成。参与转录抑制、t细胞活化、炎症反应等生命活动。cbfa2t3基因与急性髓性白血病(aml)、急性巨核细胞白血病(amkl)等相关。
● glis2
位于16p13.3。编码glis家族锌指蛋白2,由524个氨基酸组成,是一个含有5个c2h2型锌指结构域的核转录因子。该基因可以抑制hedgehog信号通路,也可以抑制wnt信号通路中ctnnb1介导的转录激活,促进神经元的分化等。glis2基因与急性巨核细胞白血病(amkl)等相关。
临床解读
● cbfa2t3/glis 对应核型常为inv(16)(p13;q24)
● 20-30%急性巨核细胞白血病(amkl)患者会发生这种融合,截至目前至少有20例报道,多发生于儿童。
● 预后较差。
参考文献:
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cdk6 / mecom
● cdk6
位于7q21.2。编码细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶6,由326个氨基酸组成,参与细胞周期进程的调节,控制细胞由g1向s期的过渡,阻止异常细胞进入细胞周期。cdk6基因参与红细胞的增殖、胸腺细胞的发育、新神经元的生成等多种生命活动。cdk6基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● mecom
位于3q26.2。编码mds1和evi1复合基因座蛋白,由1051个氨基酸组成。mecom是一种转录调控因子,可以通过调节jnk和tgf-β信号,参与造血、细胞凋亡、发育、增殖、分化等生命活动。mecom基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓增生异常综合征(mds)和慢性髓性白血病(cml)等相关。
临床解读
● cdk6/mecom 对应核型常为t(3;7)(q26;q21)
● 截至目前至少有10例急性髓性白血病(aml)含有此种融合,年龄范围为18-71岁。
● 预后较差。
参考文献:
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chic2 / etv6
● chic2
又名btl,位于4q12。编码富含半胱氨酸的疏水结构域2。该蛋白含有富含半胱氨酸的疏水性结构域(chic),由165个氨基酸组成,参与胞吐作用。chic2基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● etv6
位于12p13.2。编码一种转录因子,由452个氨基酸组成,包括与其他蛋白相互作用的pnt结构域和dna结合结构域。etv6蛋白参与造血和血管网络的维持,在胚胎发育和造血调节中起关键作用,对于骨髓中建立所有造血谱系至关重要。etv6基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性淋巴细胞白血病(cml)等相关。
临床解读
● chic2(btl)/etv6对应核型常为:t(4;12)(q12;p13)
● 截至目前至少有17例报道,其中aml病例均为成人(43-81岁),all病例均为儿童(3-14岁)。
● 成人治疗反应较差,中位生存期位1年。儿童预后意义不明。
参考文献:
[1] harada h, harada y, eguchi m, et al. characterization of acute leukemia with t(4;12).[j]. leukemia & lymphoma, 1997, 25(1-2):47.
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[5] alkali a, cherry m, kimmell k, et al. a case of acute myeloid leukemia initially treated as chronic lymphocytic leukemia: what do we know about t(4;12)(q12;p13)?[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2010, 203(2):348-51.
cntrl / fgfr1
● cntrl
位于9q33.2。编码centriolin,由2325个氨基酸组成,是一种中心体蛋白,与中心体的成熟相关,参与细胞周期进程的调控和胞质分裂。cntrl基因与骨髓增生性疾病(mpd)等相关。
● fgfr1
又名flt2,位于8p11.23。编码成纤维细胞生长因子受体1,由822个氨基酸组成,是一种受体酪氨酸激酶。该蛋白主要包括3个免疫球蛋白样结构域、1个疏水跨膜结构域、1个酪氨酸激酶结构域。作为成纤维细胞生长因子的受体,主要参与pi3k和mapk信号通路的调控,参与胚胎的发育、细胞的增殖、分化等生命活动。fgfr1基因与间变性大细胞淋巴瘤、骨髓增生性疾病(mpd)等相关。
临床解读
● cntrl/fgfr1对应核型常为:t(8;9)(p12;q33)
● 常见于t细胞骨髓增生性疾病(mpd),截至目前至少有9例报道。
● 中位生存期是12个月,小部分病例后期转化为aml或all。
参考文献:
[1] sohal j, chase a, mould s, et al. identification of four new translocations involving fgfr1, in myeloid disorders[j]. genes chromosomes & cancer, 2001, 32(2):155–163.
[2] ren m, qin h, kitamura e, et al. dysregulated signaling pathways in the development of cntrl-fgfr1-induced myeloid and lymphoid malignancies associated with fgfr1 in human and mouse models.[j]. blood, 2013, 122(6):1007-16.
ebf1 / pdgfrb
● ebf1
又名coe1,位于5q33.3。编码早期b细胞因子,该蛋白由591个氨基酸组成,是一种转录激活因子,主要包含ipt/tig结构域,可以结合dna特殊的回文序列。ebf1基因与急性淋巴细胞白血病(all)等相关。
● pdgfrb
位于 5q32。编码血小板衍生生长因子受体β,由1106个氨基酸组成,是一种受体酪氨酸激酶。该蛋白的活化可以激活下游的pi3k-akt-mtor及ras-raf-mapk等信号通路,参与胚胎发育、血管生成、细胞增殖、存活、发育、分化、迁移等生命活动。pdgfrb基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml)、慢性骨髓单核细胞白血病(cmml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性嗜酸粒细胞性白血病(cel)及骨髓增生性疾病(mpd)等相关。
临床解读
● ebf1/pdgfrb对应核型常为:del(5)(q32;q33)
● 常见于b细胞前体急性淋巴细胞白血病(bcp-all),截至目前至少有25例报道,多发于儿童,平均年龄12岁。
● 含有该融合的all对伊马替尼、达沙替尼治疗敏感。部分患者可发生高水平的微小残留mrd(水平6%-30%),经过大剂量化疗后,可缓解。
参考文献:
[1] schwab c, ryan s l, chilton l, et al. ebf1-pdgfrb fusion in pediatric b-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (bcp-all): genetic profile and clinical implications[j]. blood, 2016, 127(18):2214.
[2] lengline e, beldjord k, dombret h, et al. successful tyrosine kinase inhibitor therapy in a refractory b-cell precursor acute lymphoblastic leukemia with ebf1-pdgfrb fusion[j]. haematologica, 2013, 98(11):146-8.
[3] weston b w, hayden m a, roberts k g, et al. tyrosine kinase inhibitor therapy induces remission in a patient with refractory ebf1-pdgfrb–positive acute lymphoblastic leukemia[j]. journal of clinical oncology, 2013, 31(25): e413-e416.
kat6a / crebbp
● kat6a
又名myst3、moz,位于8p11.21。编码赖氨酸乙酰转移酶6a,是一种转录调控因子,由2004个氨基酸组成。由1个核定位结构域、1个结合乙酰化组蛋白尾部的双c2h2锌指结构域、1个组蛋白乙酰转移酶结构域、1个富含谷氨酸/天冬氨酸的区域以及1个富含丝氨酸和富甲硫氨酸的反式激活结构域组成,可乙酰化组蛋白h3、h4、tp53等。kat6a基因与骨髓异常增生综合征(mds)、急性髓性白血病(aml)等相关。
● crebbp
又名cbp,位于16p13.3。编码creb结合蛋白,是一种转录激活因子,也是一种camp结合蛋白,由2442个氨基酸组成。具有乙酰转移酶活性,参与组蛋白和非组蛋白的乙酰化。参与细胞周期进程的调节,控制细胞由g1向s的过渡,阻止异常细胞进入细胞周期,在细胞分化、凋亡和增殖过程中具有重要作用。crebbp基因与急性髓性白血病(aml)有关。
临床解读
● kat6a / crebbp(moz / cbp)对应核型常为:t(8;16)(p11;p13)
● 常见于急性髓性白血病(aml),截至目前至少有120例报道。
● 成人预后较差,儿童预后可能较好。文献报道中,半数患者在诊断后10个月内死亡,其余生存期常低于1年,有1例先天性aml患者长期生存。有患者在治疗过程中曾出现过自行缓解的情况(有患者会多次出现),这种情况多见于儿童,现有报道成人1例。
参考文献:
[1] heim s, avanzi g c, billstroum r, et al. a new specific chromosomal rearrangement, t (8; 16)(p11; p13), in acute monocytic leukaemia[j]. british journal of haematology, 1987, 66(3): 323-326.
[2] sun t, wu e. acute monoblastic leukemia with t(8;16): a distinct clinicopathologic entity; report of a case and review of the literature †[j]. american journal of hematology, 2001, 66(3):207–212.
[3] sun t, wu e. acute monoblastic leukemia with t(8;16): a distinct clinicopathologic entity; report of a case and review of the literature †[j]. american journal of hematology, 2001, 66(3):207–212.
[4] http://www.atlasgeneticsoncology.org/anomalies/t0816id1018.html
[5] daifu t, kato i, kozuki k, et al. the clinical utility of genetic testing for t(8;16)(p11;p13) in congenital acute myeloid leukemia[j]. journal of pediatric hematology/oncology, 2014, 36(5):325-7.
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[7] hoshino t, taki t, takada s, et al. spontaneous remission of adult acute myeloid leukemia with t(8;16)(p11;p13)/moz-cbp fusion.[j]. leukemia & lymphoma, 2017:1.
etv6 / flt3
● etv6
位于12p13.2。编码一种转录因子,由452个氨基酸组成,包括与其他蛋白相互作用的pnt结构域和dna结合结构域。etv6蛋白参与造血和血管网络的维持,在胚胎发育和造血调节中起关键作用,对于骨髓中建立所有造血谱系至关重要。etv6基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性淋巴细胞白血病(cll)等相关。
● flt3
位于13q12.2,编码fms相关酪氨酸激酶3,是一种受体酪氨酸激酶,由993个氨基酸组成。主要参与pi3k-akt-mtor信号通路的调控,与骨髓中造血细胞的凋亡、增殖和分化有关。flt3基因与急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)等相关。
临床解读
● etv6 / flt3对应核型常为:t(12;13)(p13;q12)
● 可见于髓系/淋系肿瘤伴嗜酸性粒细胞增多(mln-eos),非常罕见,截至目前至少有5例报道,均为成人。
● 文献报道中生存期差异较大。1例68岁女性患者,诊断后生存期21个月。1例33岁男性患者接受异基因造血干细胞移植(allo-sct)后并经化疗,生存期为75个月。1例40岁女性患者,应用flt3抑制剂索拉非尼(sorafenib)及异基因造血干细胞移植(allo-sct)治疗,反馈疗效较好,具体生存期未见报道。
参考文献:
[1] vu h a, xinh p t, masuda m, et al. flt3 is fused to etv6 in a myeloproliferative disorder with hypereosinophilia and at (12; 13)(p13; q12) translocation[j]. leukemia, 2006, 20(8): 1414-1421.
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[3] chonabayashi k, hishizawa m, matsui m, et al. successful allogeneic stem cell transplantation with long-term remission of etv6/flt3-positive myeloid/lymphoid neoplasm with eosinophilia[j]. annals of hematology, 2014, 93(3): 535-537.
[4] falchi l, mehrotra m, newberry k j, et al. etv6-flt3 fusion gene–positive, eosinophilia-associated myeloproliferative neoplasm successfully treated with sorafenib and allogeneic stem cell transplant[j]. leukemia, 2014, 28(10): 2090.
kat6a / ncoa2
● kat6a
又名myst3、moz,位于8p11.21。编码赖氨酸乙酰转移酶6a,是一种转录调控因子,由2004个氨基酸组成。由1个核定位结构域、1个结合乙酰化组蛋白尾部的双c2h2锌指结构域、1个组蛋白乙酰转移酶结构域、1个富含谷氨酸/天冬氨酸的区域以及1个富含丝氨酸和富甲硫氨酸的反式激活结构域组成,可乙酰化组蛋白h3、h4、tp53等。kat6a基因与骨髓异常增生综合征(mds)、急性髓性白血病(aml)等相关。
● ncoa2
又名tif2,位于8q13.3。编码核受体共激活因子2,是一种胆固醇受体和核受体的转录激活因子,由1464个氨基酸组成。参与脂肪和葡萄糖的代谢。ncoa2基因与急性淋巴细胞白血病(all)和急性髓性白血病(aml)等相关。
临床解读
● kat6a / ncoa2对应的核型常为:inv(8)(p11;q13)
● 常见于伴有爆发性红细胞增多症的急性髓性白血病(aml),截至目前至少有8例报道,其中4例为青少年患者(<18岁)。女性多见。
● 成人预后较差,儿童预后较好。文献报道中,4例儿童患者在接受基本治疗后获得缓解(3例完全缓解)。2例成人患者未能获得持续缓解。
参考文献:
[1] abdelhaleem m, shago m, beimnet k, et al. childhood acute myeloid leukemia with hemophagocytosis by the blasts and inv(8)(p11q13) with moz-tif2 fusion transcripts.[j]. journal of pediatric hematology/oncology, 2007, 29(9):643-5.
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[4] panagopoulos i, teixeira m r, micci f, et al. acute myeloid leukemia with inv(8)(p11q13)[j]. leukemia & lymphoma, 2000, 39(5-6):651.
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runx1 / mecom
● runx1
又名aml1,位于21q22.12。编码runt相关转录因子1,是一种核心结合因子,由453个氨基酸组成。runx1作为转录因子可以与许多基因增强子或启动子的核型元件结合。runx1参与造血干细胞的产生及骨髓和淋巴细胞的分化。runx1基因与慢性髓性白血病(cml)等相关。
● mecom
又名mds1/evi1,位于3q26.2。编码mds1和evi1复合基因座蛋白,由1051个氨基酸组成。mecom是一种转录调控因子,可以通过调节jnk和tgf-β信号,参与造血、细胞凋亡、发育、增殖、分化等生命活动。mecom基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓增生异常综合征(mds)和慢性髓性白血病(cml)等相关。
临床解读
● runx1 / mecom对应的核型常为:t(3;21)(q26;q22)
● 常见于治疗相关的急变期慢性髓性白血病(t-bc-cml)、骨髓增生异常综合征(t-mds)及急性髓性白血病(t-aml),有研究认为曾接受羟基脲素或其他抗代谢药物治疗可能是引发的原因之一。截至目前至少有146例报道,男性占59%。42例bc-cml中,男性占71%。
● 预后不良,bc-cml中位生存期9个月,mds/aml中位生存期4个月。
参考文献:
[1]http://atlasgeneticsoncology.org//anomalies/t0321id1009.html
[2] baldazzi c, luatti s, zuffa e, et al. complex chromosomal rearrangements leading to mecom overexpression are recurrent in myeloid malignancies with various 3q abnormalities[j]. genes chromosomes & cancer, 2016, 55(4):375-388.
[3] yin c c, cortes j, barkoh b, et al. t(3;21)(q26;q22) in myeloid leukemia: an aggressive syndrome of blast transformation associated with hydroxyurea or antimetabolite therapy[j]. cancer, 2006, 106(8):1730.
[4] berger r, busson m, dastugue n, et al. acute megakaryoblastic leukemia and loss of the runx1, gene[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2006, 164(1):71.
kmt2a / crebbp
● kmt2a
又名mll,位于11q23.3。编码赖氨酸甲基转移酶2a,是一种转录共激活因子,由3969个氨基酸组成。kmt2a在早期发育和造血过程中具有重要作用。kmt2a包含多个功能,既可以介导组蛋白h3的赖氨酸甲基化,又可以介导组蛋白h4赖氨酸的乙酰化。kmt2a基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● crebbp
又名cbp,位于16p13.3。编码creb结合蛋白,是一种转录激活因子,也是一种camp结合蛋白,由2442个氨基酸组成。具有乙酰转移酶活性,参与组蛋白和非组蛋白的乙酰化。参与细胞周期进程的调节,控制细胞由g1向s的过渡,阻止异常细胞进入细胞周期,在细胞分化、凋亡和增殖过程中具有重要作用。crebbp基因与急性髓性白血病(aml)有关。
临床解读
● kmt2a / crebbp对应核型常为:t(11;16)(q23;p13.3)
● 常见于治疗相关性/继发性(多为曾接受topo ⅱ抑制剂化疗)的骨髓增生异常综合征(t-mds)和急性白血病(其中t-aml较t-all多见),截至目前至少有22例报道,各年龄阶段均有分布。
● 预后不良。
参考文献:
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nup98 / ddx10
● nup98
位于11p15.4。编码核孔蛋白98,由1817个氨基酸组成。参与核孔复合物的组装和维护,调节细胞核与细胞质间的大分子转运。nup98基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● ddx10
位于11q22.3。编码dead-box 解旋酶,是一种rna解旋酶,由875个氨基酸组成。该蛋白通过调控rna二级结构的改变参与多种生命活动,比如翻译起始和线粒体内rna的选择性剪接以及核小体和剪接体的组装。ddx10也参与胚胎发育、精子形成、细胞的生长和分化等生命活动。ddx10基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
临床解读
● nup98 / ddx10对应的核型常为:inv(11)(p15q22) 或t(11;11)(p15;q22)
● 常见于骨髓恶性肿瘤,截至目前至少有16例报道,成人儿童各半,以男性多见(12/16例)。其中9例原发性(7例aml、1例mds、1例cml),6例治疗相关性(3例aml、2例mds、1例cmml)。
● 预后不良。
参考文献:
[1] choi r, jang m a, yoo k h, et al. the first korean case of childhood acute myeloid leukemia with inv(11)(p15q22)/nup98-ddx10 rearrangement: a rare but recurrent genetic abnormality[j]. annals of laboratory medicine, 2014, 34(6):478-480.
[2] gorello p, nofrini v, brandimarte l, et al. inv(11)(p15q22)/nup98-ddx10 fusion and isoforms in a new case of de novo acute myeloid leukemia[j]. cancer genetics, 2013, 206(3):92-96.
[3] hollink i h i m, heuvel-eibrink m m v d, arentsen-peters s t c j m, et al. nup98/nsd1 characterizes a novel poor prognostic group in acute myeloid leukemia with a distinct hox gene expression pattern.[j]. blood, 2011, 118(13):3645-56.
nup98 / nsd1
● nup98
位于11p15.4。编码核孔蛋白98,由1817个氨基酸组成。参与核孔复合物的组装和维护,调节细胞核与细胞质间的大分子转运。nup98基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● nsd1
位于5q35.2。编码核受体结合set域蛋白1,是一个转录因子,由2696个氨基酸组成。nsd1是一个含有1个set结构域、2个lxxll基序、3个核易位信号区域(nlss)、4个植物同源结构(phd)指区域和1个富含脯氨酸区域的蛋白质。nsd1可以增强雄激素受体(ar)反式激活,并且在其他雄激素受体相关调节因子的辅助下,这种增强可以进一步增加。nsd1可以作为具有核定位功能的基本转录因子,也可以作为双功能转录调节子。nsd1基因与急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)等相关。
临床解读
● nup98 / nsd1对应核型常为:t(5;11)(q35;p15.5)
● 常见于急性髓性白血病(aml),截至目前至少有5例报道,多为儿童或青少年(年龄3-18岁)。
● 预后较差,4年无进展生存率为10%。
参考文献:
[1] hollink i h i m, heuvel-eibrink m m v d, arentsen-peters s t c j m, et al. nup98/nsd1 characterizes a novel poor prognostic group in acute myeloid leukemia with a distinct hox gene expression pattern.[j]. blood, 2011, 118(13):3645-56.
[2] brown j, jawad m, twigg s r, et al. a cryptic t(5;11)(q35;p15.5) in 2 children with acute myeloid leukemia with apparently normal karyotypes, identified by a multiplex fluorescence in situ hybridization telomere assay.[j]. blood, 2002, 99(7):2526-31.
[3] jaju r j, fidler c, haas o a, et al. a novel gene, nsd1, is fused to nup98 in the t(5;11)(q35;p15.5) in de novo childhood acute myeloid leukemia.[j]. blood, 2001, 98(4):1264.
[4] jaju r j, haas o a, neat m, et al. a new recurrent translocation, t(5;11)(q35;p15.5), associated with del(5q) in childhood acute myeloid leukemia. the uk cancer cytogenetics group (ukccg)[j]. blood, 1999, 94(2):773.
nup98 / kdm5a
● nup98
位于11p15.4。编码核孔蛋白98,由1817个氨基酸组成。参与核孔复合物的组装和维护,调节细胞核与细胞质间的大分子转运。nup98基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● kdm5a
又名jarid1a,位于12p13.33。编码赖氨酸脱甲基酶5a,是一个组蛋白去甲基化酶,由1690个氨基酸组成。kdm5a通过对组蛋白h3的赖氨酸残基去甲基化,对相关基因进行调控。kdm5a在调节细胞分化、调节昼夜节律等生命过程中具有重要作用。kdm5a基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
临床解读
● nup98 / kdm5a对应核型常为:t(11;12)(p15;p13)
● 常见于急性巨核细胞白血病(amkl,为aml的m7亚型),截至目前至少有7例报道,多为儿童,有年龄性别信息的5例都是男孩,年龄范围1-4岁。
● 预后较差。但有1例预后较好,完全缓解时间超过了5年。
参考文献:
[1] thiollier c, lopez c k, gerby b, et al. characterization of novel genomic alterations and therapeutic approaches using acute megakaryoblastic leukemia xenograft models[j]. journal of experimental medicine, 2012, 209(11):2017-31.
[2] de rooij j d, masetti r, mm h e, et al. recurrent genetic abnormalities can be used for risk-group stratification in pediatric amkl: results of a retrospective intergroup study[j]. blood, 2016, 127(26):3424-3430.
[3] van zutven l j, onen e, velthuizen s c, et al. identification of nup98 abnormalities in acute leukemia: jarid1a (12p13) as a new partner gene[j]. genes chromosomes & cancer, 2006, 45(5):437-46.
[4] http://atlasgeneticsoncology.org//anomalies/t1112p15p13id1428.html
nup98 / psip1
● nup98
位于11p15.4。编码核孔蛋白98,由1817个氨基酸组成。参与核孔复合物的组装和维护,调节细胞核与细胞质间的大分子转运。nup98基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● psip1
位于9p22.3。编码pc4/sfrs关联蛋白2,是一个转录激活因子,由530个氨基酸组成。psip1参与神经上皮干细胞分化、神经的形成及细胞凋亡等生命活动。psip1基因与急性髓性白血病(aml)、慢性髓性白血病(cml)等相关。
临床解读
● nup98 / psip1对应的核型常为:t(9;11)(p22;p15)
● 是一种重现性易位,常见于原发性急性髓性白血病(aml),也可见于慢性髓性白血病急变期(cml-bc)和骨髓增生异常综合征(mds)。截至目前至少有7例报道,5例aml(4例为女性)、1例cml、1例mds。
● 预后较差。
参考文献:
[1] yamamoto k, nakamachi y, yakushijin k, et al. expression of the novel nup98/psip1 fusion transcripts in myelodysplastic syndrome with t(9;11)(p22;p15)[j]. european journal of haematology, 2012, 88(3):244-248.
[2] lundin c, horvat a, karlsson k, et al. t(9;11)(p22;p15) [nup98/psip1] is a poor prognostic marker associated with de novo acute myeloid leukaemia expressing both mature and immature surface antigens[j]. leukemia research, 2011, 35(6):75-6.
mn1 / etv6
● mn1
位于22q12.1。编码一个转录激活因子mn1,是一个原癌基因,由1320个氨基酸组成。mn1含有2个cag重复区。mn1在腭发育后期参与tbx22的表达调控。在腭发育后期,mn1是腭突的生长和中间融合所必需的。mn1促进颅骨成骨细胞的成熟和功能实现,包括调控破骨细胞因子tnfsf11 / rankl的表达。mn1对于颅骨膜骨的正常发育是必要的。mn1基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓异常增生综合征(mds)等相关。
● etv6
又名tel,位于12p13.2。编码一种转录因子,由452个氨基酸组成,包括与其他蛋白相互作用的pnt结构域和dna结合结构域。etv6蛋白参与造血和血管网络的维持,在胚胎发育和造血调节中起关键作用,对于骨髓中建立所有造血谱系至关重要。etv6基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性淋巴细胞白血病(cll)等相关。
临床解读
● mn1 / etv6(mn1 / tel)对应核型常为:t(12;22)(p13;q12)
● 常见于急性髓性白血病(aml),也可见于骨髓异常增生综合征(mds),截至目前至少有11例报道。年龄范围8-60岁。
● 预后较差。生存期为0个月-6年,中位生存期2年。
参考文献:
[1] nofrini v, berchicci l, starza r l, et al. mn1-etv6, fusion gene arising from mds with 5q−[j]. leukemia research, 2011, 35(7):123-6.
[2] gotou m, hanamura i, nagoshi h, et al. establishment of a novel human myeloid leukemia cell line, amu-aml1, carrying t(12;22)(p13;q11) without chimeric mn1-tel and with high expression of mn1.[j]. genes chromosomes cancer, 2012, 51(1):42-53.
runx1 / cbfa2t3
● runx1
又名aml1,位于21q22.12。编码runt相关转录因子1,是一种核心结合因子,由453个氨基酸组成。runx1作为转录因子可以与许多基因增强子或启动子的核型元件结合。runx1参与造血干细胞的产生及骨髓和淋巴细胞的分化。runx1基因与慢性髓性白血病(cml)等相关。
● cbfa2t3
位于16q24.3。编码cbfa2/runx1易位伴侣3,是一种转录抑制因子,由653个氨基酸组成。cbfa2t3通过与其他转录抑制因子及组蛋白修饰酶协同作用促进转录抑制。cbfa2t3在zbtb33依赖生命活动中,抑制mmp7表达。cbfa2t3可以降低转录调控因子hif1a的蛋白质水平和稳定性。还可以与egln1相互作用促进hif1a脯氨酰羟化依赖性泛素化和蛋白酶体降解途径。cbfa2t3通过下调糖酵解基因pfkfb3、pfkfb4、pdk1、pfkp、ldha和hk1等(hif1a的直接靶点),抑制糖酵解和呼吸作用。通过抑制tal1的表达调节红系祖细胞的增殖和分化。cbfa2t3基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓异常增生综合征(mds)等相关。
临床解读
● runx1 / cbfa2t3对应核型常为:t(16;21)(q24;q22)
● 常见于原发性与治疗相关性急性髓性白血病(aml),截至目前至少有27例报道。成人患者多见(22例,19-76岁,女性患者偏多),其中17例为治疗相关性。儿童少见(5例,4-15岁),其中3例为原发性。
● 成人预后较差,儿童预后相对较好。有3例表现出嗜酸性粒细胞增多,预后更差,生存期最短不足1个月。1例经化疗有效果,无复发生存达到70个月。
参考文献:
[1] lavallée v p, lemieux s, boucher g, et al. rna-sequencing analysis of core binding factor aml identifies recurrent zbtb7a mutations and defines runx1-cbfa2t3 fusion signature.[j]. blood, 2016, 127(20):2498-2501.
[2] kawashima n, shimada a, taketani t, et al. childhood acute myeloid leukemia with bone marrow eosinophilia caused by t(16;21)(q24;q22)[j]. international journal of hematology, 2012, 95(5):577-580.
[3] park i j, park j e, kim h j, et al. acute myeloid leukemia with t(16;21)(q24;q22) and eosinophilia: case report and review of the literature[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2010, 196(1):105.
nup98 / top1
● nup98
位于11p15.4。编码核孔蛋白98,由1817个氨基酸组成。参与核孔复合物的组装和维护,调节细胞核与细胞质间的大分子转运。nup98基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● top1
位于20q12。编码dna拓扑异构酶1,由765个氨基酸组成。top1具有dna单链内切酶和dna连接酶活性,可以通过瞬间切割然后重新连接dna中的一条链,改变dna的拓扑结构,释放dna复制和转录过程中引入的dna超螺旋和扭曲张力。top1基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓异常增生综合征(mds)等相关。
临床解读
● nup98/top1对应核型常为:t(11;20)(p15;q11)
● 常见于原发性急性髓性白血病(aml),也可见于治疗相关性骨髓异常增生综合征(t-mds),截至目前至少有11例报道。8例原发性aml,3例t-mds,多为年轻患者。
● 预后较差。生存期为0-16个月,中位生存期9个月。
参考文献:
[1] motti h, irit a, nivin m, et al. treatment-related acute myeloid leukemia characterized by t(11;20)(p15;q11) and del(9)(q22)[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2006, 167(2):186-8.
[2] potenza l, sinigaglia b, luppi m, et al. a t(11;20)(p15;q11) may identify a subset of nontherapy-related acute myelocytic leukemia.[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2004, 149(2):164-8.
[3] yamamoto k, minami y, yakushijin k, et al. coexpression of nup98/top1 and top1/nup98 in de novo acute myeloid leukemia with t(11;20)(p15;q12) and t(2;5)(q33;q31)[j]. cytogenetic & genome research, 2016, 150(3-4):287.
[4] ganguly b b, loher y, agarwal m b. translocation t(11;20)(p15;q11) detected in aml m0: a case report[j]. 2011.
pdgfra / etv6
● pdgfra
又名chic2,位于4q12。编码血小板衍生生长因子受体α,由1089个氨基酸组成。是一种受体酪氨酸激酶。该蛋白的活化可以激活下游的pi3k-akt-mtor及ras-raf-mapk等信号通路,参与胚胎发育,血管生成,细胞增殖、存活、发育、分化、迁移等生命活动。pdgfra基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml),慢性骨髓单核细胞白血病(cmml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性嗜酸粒细胞性白血病(cel)及骨髓增生性疾病(mpd)等相关。
● etv6
又名tel,位于12p13.2。编码一种转录因子,由452个氨基酸组成,包括与其他蛋白相互作用的pnt结构域和dna结合结构域。etv6蛋白参与造血和血管网络的维持,在胚胎发育和造血调节中起关键作用,对于骨髓中建立所有造血谱系至关重要。etv6基因与慢性髓性白血病(cml)、急性髓性白血病(aml)、急性淋巴细胞白血病(all)、慢性淋巴细胞白血病(cll)等相关。
临床解读
● pdgfra / etv6对应核型常为:t(4;12)(q12;p13)
● 常见于急性髓性白血病(aml),截至目前至少有20例报道,多见于成年人。
● 预后较差。化疗效果差,易复发。
参考文献:
[1] abe a, mizuta s, okamoto a, et al. transcriptional activation of platelet‐derived growth factor receptor α and gs homeobox 2 resulting from e26 transformation‐specific variant 6 translocation in a case of acute myeloid leukemia with t(4;12)(q12;p13)[j]. international journal of laboratory hematology, 2016, 38(2):e15–e18.
[2] al-kali a, cherry m, kimmell k, et al. a case of acute myeloid leukemia initially treated as chronic lymphocytic leukemia: what do we know about t(4;12)(q12;p13)?[j]. cancer genetics & cytogenetics, 2010, 203(2):348-351.
npm1 / mlf1
● npm1
位于5q35.1。编码nucleophosmin,由294个氨基酸组成,是一种在细胞核与细胞质之间移动的磷蛋白。npm1涉及核糖体生成,中心体复制,蛋白转运,组蛋白组装,细胞增殖,tp53、arf调控等多种生命活动。npm1是who对aml分类的一个重要标志物,建议cn-aml患者进行npm1突变检测。npm1基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● mlf1
位于3q25.32。编码髓系白血病因子1,由267个氨基酸组成,是一个癌蛋白。该蛋白可以抑制红细胞系的形成,并增强骨髓的形成。mlf1可以通过抑制cdkn1b/p27kip1水平,组织细胞离开细胞周期,参与红细胞生成素诱导的红细胞终端分化。mlf1可以通过csn3(激活p53并诱导细胞周期停滞)抑制rfwd2/op1活性。mlf1可以结合dna并影响许多基因的表达,在细胞核中起转录因子的作用。mlf1基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
临床解读
● npm1 / mlf1对应核型常为:t(3;5)(q25;q34)
● 常见于急性髓性白血病(aml),截至目前至少有25例报道,多见于成年人。
● 预后较差,中位生存期小于1年。
参考文献:
[1] berger r, busson m, baranger l, et al. loss of the npm1 gene in myeloid disorders with chromosome 5 rearrangements[j]. leukemia, 2006, 20(2):319-21.
[2] dumézy f, renneville a, mayeur-rousse c, et al. acute myeloid leukemia with translocation t(3;5): new molecular insights[j]. haematologica, 2013, 98(4):52-4.
[3] glasser l, meloni-ehrig a, greaves w, et al. synchronous development of acute myeloid leukemia in recipient and donor after allogeneic bone marrow transplantation: report of a case with comments on donor evaluation[j]. transfusion, 2009, 49(3):555–562.
bcl11a / mecom
● bcl11a
位于2p16.1。编码b-cell lymphoma/leukemia 11a,由835个氨基酸组成,是一个转录因子。bcl11a是胎儿血红蛋白(hbf)水平的抑制因子,参与大脑发育、造血及淋巴细胞生成等生命活动。mlf1可以结合dna并影响许多基因的表达,在细胞核中起转录因子的作用。bcl11a基因与急性髓性白血病(aml)等相关。
● mecom
又名mds1/evi1,位于3q26.2。编码mds1和evi1复合基因座蛋白,由1051个氨基酸组成。mecom是一种转录调控因子,可以通过调节jnk和tgf-β信号,参与造血,细胞凋亡、发育、增殖、分化等生命活动。mecom基因与急性髓性白血病(aml)、骨髓增生异常综合征(mds)和慢性髓性白血病(cml)等相关。
临床解读
● bcl11a / mecom(evi1)对应核型常为:t(2; 3)(p16; q26)
● 常见于急性髓性白血病(aml),截至目前至少有4例报道,均为成人(36-55岁)。
● 患者至少表现出两种骨髓细胞谱系的发育不良。bcl11a / mecom和thada / mecom同时存在的情况下的临床表现比较严重。
参考文献:
[1] trubia m, albano f, cavazzini f, et al. characterization of a recurrent translocation t(2;3)(p15|[ndash]|22;q26) occurring in acute myeloid leukaemia[j]. leukemia, 2006, 20(1):48-54.
注:文中染色体图片来自https://decipher.sanger.ac.uk/
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文 / 遗传咨询师 张娟、张良程